【第2話】
城之内克也vs真崎杏子
インセクター羽蛾vsダイナソー竜崎
武藤遊戯（闇）vsペガサス・J・クロフォード
【第4話～第5話】
武藤遊戯（闇）vsインセクター羽蛾
【第6話】
城之内克也vs孔雀舞
【第7話】
武藤遊戯（闇）vs梶木漁太
【第8話】
武藤遊戯（闇）vs海馬モクバ
【第9話～第10話】
武藤遊戯（闇）vs死の物真似師（原作版：死者の腹話術師）
【第11話～第12話】
城之内克也vsダイナソー竜崎
【第13話】
武藤遊戯（闇）vs獏良了（闇）
【第14話～第15話】
孔雀舞vs闇のプレイヤーキラー
武藤遊戯（闇）vs闇のプレイヤーキラー
【第16話】
城之内克也vs海馬瀬人
トムvsキース・ハワード
【第17話～第18話】
城之内克也vsゴースト骨塚
【第19話～第21話】
武藤遊戯（闇）&城之内克也vs迷宮兄弟
【第22話～第24話】
武藤遊戯（闇）vs海馬瀬人
【第25話】
真崎杏子vs孔雀舞
【第26話～第27話】
海馬瀬人vsペガサス・J・クロフォード
【第29話～第30話】
武藤遊戯（闇）vs孔雀舞
【第31話～第32話】
城之内克也vsキース・ハワード
【第33話～第34話】
武藤遊戯（闇）vs城之内克也
【第35話～第39話】
武藤遊戯（闇）vsペガサス・J・クロフォード
【第41話～第42話】
武藤遊戯（表）vsレベッカ・ホプキンス
武藤双六vsアーサー・ホプキンス ※回想シーン
【第46話】
城之内克也vs御伽龍児
【第50話～第51話】
武藤遊戯（表）vsキース・ハワード
【第53話】
武藤遊戯（闇）vsステップ・ジョニー
【第54話】
海馬瀬人vsデュエルロボ
【第55話】
城之内克也vsレアハンター
【第56話～第57話】
武藤遊戯（闇）vsレアハンター
【第58話】
ダイナソー竜崎vsエスパー絽場
【第58話～第59話】
城之内克也vsエスパー絽場
【第60話】
海馬瀬人vs名蜘蛛コージ
【第60話～第62話】
武藤遊戯（闇）vsパンドラ
【第63話～第64話】
城之内克也vsインセクター羽蛾
【第65話～第67話】
武藤遊戯（闇）vsマリクの人形
【第68話】
武藤遊戯（闇）&海馬瀬人vsレアハンター
【第68話～第69話】
城之内克也vs梶木漁太
【第70話～第73話】
武藤遊戯（闇）&海馬瀬人vs光の仮面&闇の仮面
【第75話～第78話】
武藤遊戯（闇→表）vs城之内克也
【第79話】
獏良了（闇）vsゴースト骨塚
【第80話】
孔雀舞vsジョン・クロード・マグナム
【第82話～第84話】
武藤遊戯（闇）vs獏良了（闇）
【第86話～第89話】
城之内克也vsリシド
【第90話～第92話】
孔雀舞vsマリク・イシュタール（闇）
【第93話～第94話】
海馬瀬人vsイシズ・イシュタール
【第96話～第97話】
獏良了（闇）vsマリク・イシュタール（闇）
【第99話～第101話】
武藤遊戯（闇）vs大下幸之助
【第102話～第103話】
真崎杏子vs大瀧修三
【第104話～第105話】
城之内克也vs大岡筑前
【第106話～第107話】
御伽龍児&本田ヒロト&川井静香vs大田宗一郎
【第108話～第109話】
海馬瀬人vs大門小五郎
【第111話～第113話】
武藤遊戯（闇）&城之内克也vsBIG5
【第114話～第118話】
海馬瀬人→武藤遊戯（闇）vs海馬乃亜
【第120話～第121話】
海馬瀬人vs海馬剛三郎
【第122話～第124話】
武藤遊戯（闇）vs城之内克也vs海馬瀬人vsマリク・イシュタール（闇）
【第125話～第128話】
城之内克也vsマリク・イシュタール（闇）
【第129話～第134話】
武藤遊戯（闇）vs海馬瀬人
【第135話～第137話】
城之内克也vs海馬瀬人
【第138話～第142話】
武藤遊戯（闇）vsマリク・イシュタール（闇）
【R特別編】
武藤遊戯（闇）vs百野真澄
【映画「光のピラミッド」】
海馬瀬人vsペガサス・J・クロフォード
武藤遊戯（闇）vs海馬瀬人→アヌビス
【第145話～第146話】
武藤遊戯（闇）vsグリモ
【第149話～第150話】
海馬瀬人vs偽ペガサス→アメルダ
【第151話～第154話】
ペガサス・J・クロフォードvs孔雀舞
城之内克也vs孔雀舞
【第156話～第158話】
武藤遊戯（闇）vsラフェール
【第160話～第162話】
城之内克也vsダイナソー竜崎
武藤遊戯（闇）vsインセクター羽蛾
【第163話】
闇遊戯vs表遊戯（幻）
【第164話】
武藤遊戯（闇）vsオレイカルコス・ソルジャー
【第165話】
レベッカ・ホプキンス&御伽龍児vsヴァロン
【第166話～第167話】
海馬瀬人vsアメルダ
【第169話～第172話】
城之内克也vsヴァロン
【第172話～第173話】
城之内克也vs孔雀舞
【第174話～第176話】
武藤遊戯（闇）vsラフェール
【第177話～第182話】
武藤遊戯（闇）&海馬瀬人vsダーツ
【第185話～第186話】
リック→武藤遊戯（闇）vsデュエルコンピューター
【第187話～第188話】
城之内克也vsマスク・ザ・ロック
【第189話】
レベッカ・ホプキンスvsヴィヴィアン・ウォン
ジーク・ロイドvsインセクター羽蛾&ダイナソー竜崎
【第190話～第191話】
城之内克也vsジーク・ロイド
【第192話～第193話】
レベッカ・ホプキンスvsレオン・ウィルソン
武藤遊戯（闇）vsヴィヴィアン・ウォン
【第194話～第195話】
海馬瀬人vsジークフリード・フォン・シュレイダー
【第196話～第198話】
武藤遊戯（闇）vsレオンハルト・フォン・シュレイダー
【第200話】
海馬瀬人vs獏良了（闇）
【第215話～第218話】
武藤遊戯（表）vs獏良了（闇）
【第221話～第224話】
武藤遊戯vsアテム
